由于微机线路保护装置是由各种电子元器件和CPU芯片组成的弱电工作回路，很容易受到外界谐波、强雷电波及无线电波的干扰，导致装置程序运行出错、死机、拒动或误动等不正常情况。因此，微机保护装置的抗干扰措施非常重要。除了全面执行原电力部1994年颁发的《电力系统继电保护及安全自动装置反事故措施要点》及1996年原电力部颁发的《微机继电保护装置运行管理规程》的有关规定，严格按照有关规程、反措进行设计、施工和验收外，广州电力局还要求生产厂家对端子排的正电源与跳闸回路必须隔开3个端子排的距离，防止人为误碰或端子排老化、绝缘降低，导致控制回路误发跳闸信号事故。严格执行“不允许用电缆芯两端同时接地的方法作为抗干扰措施”。继保运行人员在进行维护工作时必须严格检查这些措施的落实情况，确保接地点接地可靠，装置的抗干扰盒工作正常。

随着现代社会通讯工具的普及，继保运行人员随身携带的手机、无线电对讲机等通讯工具对微机保护装置也会产生一定的影响。因此必须在保护安装处以及有可能使用这些通讯工具的场所，用它们发出的无线电信号对有关保护装置进行干扰试验。如果保护屏使用铁门封闭的，应分别在铁门关闭及打开的情况下进行干扰试验。试验时保护装置不允许出现任何异常现象，否则要求厂家立即处理，并全面检查执行规程、反措要求情况，绝不能马虎了事走过场。